Vísindamenn frá Kína og Þýskalandi hafa algjörlega ráðið erfðamengi kartöflunnar í fyrsta skipti, að því er TASS greinir frá. Þetta hjálpaði þeim að afhjúpa þróunarsögu þessarar plöntu og draga fram lykil DNA svæði sem tengjast vexti og sjúkdómsþoli. Upplýsingar um þetta voru birtar af fréttaþjónustu þýsku stofnunarinnar fyrir plönturækt (IPZ).
„Raðgreining á erfðamengi kartöflunnar mun gera okkur kleift að setja af stað afkastamikil ræktunaráætlanir sem munu búa til nýjar afbrigði sem eru afkastamikil en samt þola hlýnun jarðar, sem verður mikilvægt á næstu áratugum,“ sagði IPZ prófessor Korbinian Schneeberger.
Margir sveppa- og bakteríusjúkdómar trufla kartöfluræktun, auk ýmissa skaðvalda eins og Colorado kartöflubjalla og þráðorma. Vísindamenn og ræktendur eru að reyna að berjast gegn þeim með því að búa til nýjar tegundir af hefðbundnum og erfðabreyttum kartöflum.
Prófessor Schneeberger og samstarfsmenn hans hafa komið með hugsanlega lausn á þessu vandamáli í umfangsmiklu verkefni sem miðar að því að fullkomlega raðgreina erfðamengi kartöflunnar. Áður hafa vísindamenn þegar reynt að afla þessara upplýsinga, en það var hindrað af afar flókinni uppbyggingu erfðamengis kartöflunnar - það samanstendur af fjórum eins litningasettum sem innihalda mikinn fjölda endurtekningar.
Ný DNA raðgreiningartækni og reiknirit til að greina erfðafræðilegar upplýsingar hjálpuðu þýskum og kínverskum erfðafræðingum að leysa þetta vandamál fyrir Otava afbrigðið. Til að ráða erfðamengið söfnuðu vísindamenn miklum fjölda frjókorna, en erfðaefni þeirra inniheldur aðeins tvö, ekki fjögur eintök af litningunum.
Þessi nálgun einfaldaði verkefnið til muna, en á sama tíma krafðist afkóðun á mjög miklum fjölda DNA-búta og samsetningu þeirra í kjölfarið með því að nota tölvualgrím. Á endanum fengu vísindamennirnir sýndarafrit af öllu erfðamengi kartöflunnar, sem samanstendur af um það bil 3,1 milljarði erfðafræðilegra „stöfa“ - núkleótíða og inniheldur yfir 38 gen.
Síðari greining á uppbyggingu þeirra leiddi í ljós flókna þróunarsögu kartöflunnar. Vísindamenn hafa komist að því að þessi menning hefur tiltölulega nýlega lifað af tvöföldun erfðamengisins vegna skyldleikaræktunar. Að auki afhjúpuðu vísindamennirnir óvenjulegan mun á virkni afrita af sömu genum á mismunandi litningum, sem gæti haft áhrif á skilvirkni þess að fara yfir mismunandi kartöfluafbrigði.
Þessar upplýsingar, vonast vísindamenn, muni hjálpa til við að þróa nýjar tegundir eða breyta erfðamenginu á þann hátt að kartöflur vaxi hraðar, standist betur síðkorna og aðra sjúkdóma og verði einnig minna næm fyrir ýmsum streituþáttum.