Nýstárleg aðferð til að berjast gegn ræktunarsjúkdómum með því að nota staðbundnar gagnlegar jarðvegsbakteríur hefur komið fram í samstarfi vísinda og iðnaðar.
Hópur vísindamanna frá John Innes Center (Bretlandi) einangraði og prófaði hundruð stofna af Pseudomonas bakteríum úr jarðvegi sem safnað var frá bæjum og raðaði síðan erfðamengi 69 þeirra.
Með því að bera saman erfðamengi þessara stofna sem hamla virkni sjúkdómsvalda og þeirra sem gera það ekki, tókst hópnum að finna lykilaðferð til að vernda kartöfluuppskeruna gegn skaðlegum bakteríum.
Síðan, með því að nota blöndu af efnafræði og erfðafræði og röð tilrauna, sýndu vísindamennirnir að framleiðsla lítilla sameinda sem kallast hringlaga lípópeptíð er mikilvæg til að stjórna kartöfluhrúðri (bakteríasjúkdómur sem veldur verulegum skaða á kartöfluuppskerunni). Þessar litlu sameindir hafa bakteríudrepandi áhrif á sjúkdómsvaldandi hrúðurvaldandi bakteríur og hjálpa gagnlegum Pseudomonas bakteríum að flytjast til og taka upp plönturætur.
Tilraunir hafa einnig sýnt að vökvun veldur verulegum breytingum á erfðafræðilega fjölbreyttum stofni Pseudomonas í jarðvegi.
Rannsóknin, sem birt var í eLife, býður upp á aðferð þar sem vísindamenn geta rannsakað örveru á nánast hvaða svæði sem er á sviði og tekið tillit til mismunandi jarðvegs, landbúnaðarefna og umhverfisaðstæðna.
Með því að nota framfarir í háhraða erfðafræðilegri raðgreiningu geta vísindamenn prófað örveru jarðvegsins fyrir gagnlegar bakteríur og ákvarðað hvaða sameindir eru framleiddar til að bæla sýkla. Næsta skref er að fjölga og skila gagnlegum örverum á sama sviði.
Hugsanleg notkun fyrir örveruaukandi efni felur í sér að bera bakteríukokteila á yfirborð hnýði sem úða eða beint í jarðveginn með dreypiáveitu.